申请港澳通行证流程如下：
1、提交申请。申请人可先在网上提前预约申请，或直接到现场提出申请，并按照规定填写中国公民出入境证件申请表，准备好需要提交的相关证明材料；
2、数码照相。申请人需要提交本人数码照片两张，可直接在现场进行拍照；
3、采集指纹。申请人在工作人员的指引下进行指纹采集或者核验指纹，16周岁以下的申请人是否采集指纹根据其监护人的意见确定，采集后拿号等待办理；
4、受理申请。工作人员对申请人提交的材料进行初审，并出具缴费单给申请人；
5、缴纳费用。申请人到指定窗口缴纳办证及签注所需的费用，制证费用100元，签注费用以签注类型而定，并领取回执单；
6、制作证件。受理申请后，由省公安机关出入境管理机构负责制作电子港澳通行证，并将制作好的证件送回接受申请的出入境管理机构；
7、发放证件。申请人在制证完成后，到办理的出入境管理机构领取证件；若选择快递形式收件的话，只需等候快递人员上门进行签收即可。
港澳通行证如何办理 扩展
申请港澳通行证需要提交申请表和相关证明材料，包括近期正面免冠彩色照片、港澳关系人的香港或澳门居民身份证或港澳居民来往内地通行证复印件等1。
申请人需到户籍所在地的县级以上公安机关出入境管理部门提交申请，并进行数码照相和指纹采集1。申请条件包括在香港或澳门定居人员的内地配偶及其偕行的未满18周岁的子女、香港、澳门居民中的中国公民在内地所生的中国籍子女、未满18周岁需要投靠在香港或澳门定居的父母等2。
